Первоначально архиеп. Никанор был погребен в одном из приделов Одесского Кафедрального Спасо-Преображенского Собора. В 1936 году Собор был разрушен. Останки архиеп. Никанора были перезахоронены на некрополе Одесского Свято-Успенского монастыря, где и пребывают ныне. Некрополь имеет небольшую площадь и расположен рядом с южным приделом храма иконы Божией Матери «Живоносный источник» – главного храма Свято-Успенского монастыря. Могила архиеп. Никанора находится в ряду могил Херсонских епископов и имеет современное надгробие в виде плиты. За некрополем осуществляется тщательный уход. Одесский Свято-Успенский монастырь находится непосредственно на берегу Черного моря, на южной окраине современной Одессы по адресу ул. Монастырская, 6.