После смерти Федора Ивановича Борис Годунов (1598-1605 гг.) пытается продолжать активную внешнюю политику. Но в результате пресечения династии московских Рюриковичей Россия постепенно погружается в Смуту, которая резко усиливается после смерти Бориса Годунова (1605 г.) и поддерживается вмешательством со стороны Речи Посполитой в поддержку самозванца Лжедмитрия I. Попытка Василия Шуйского (1606-1610) опереться на союз со Швецией в борьбе с самозванцем Лжедмитрием II и польско-литовской интервенцией закончилась провалом. В ходе трагических событий Смутного времени Польша и Швеция, враждуя между собой, оккупировали значительную часть западных и северо-западных территорий России, польский гарнизон занял Москву, международный престиж России катастрофически упал. Только после изгнания польско-литовских интервентов из Москвы (1612 г.) и воцарения новой династии Романовых в 1613 г. Россия вновь начинает проводить самостоятельную внешнюю политику. Выход из Смуты в международном плане был закреплен Столбовским мирным договором со Швецией (1617 г.) и Деулинским перемирием с Речью Посполитой (1618 г.). Смута дорого обошлась России: были потеряны значительные территории на северо-западе (Ижорская земля) и на западе (Смоленск). Их возвращение стало главной задачей внешней политики первых русских царей из династии Романовых в XVII в.